Construída, a extramuros, sobre el camino viejo, o Cañada, del Berrueco; fue la capilla del Hospital Municipal de apestados o Lazareto de esta población.

A raíz de la Peste Negra,en el s. XIV, funciona como hospital de infectados. La Ermita, reconstruída en los años 1956 y 1957 en estilo goticista-mudéjar popular, posee sencillo porche de arco de ladrillo, cerrado con artística reja de hierro;completa el inmueble la casa del ermitaño y un jardín sobre las ruinas del antiguo hospicio, con crucero recompuesto actualmente.

San Sebastián, conocido como "Defensor de la Iglesia", es considerado Santo protector contra las epidemias.